MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 4242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011984	ATC	2	6	80026	80031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083211
1502	NC_011984	TCGG	2	8	80041	80048	0 %	25 %	50 %	25 %	222083211
1503	NC_011984	TGA	2	6	80109	80114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083211
1504	NC_011984	GCC	2	6	80135	80140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083211
1505	NC_011984	TCT	2	6	80217	80222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083211
1506	NC_011984	GC	3	6	80249	80254	0 %	0 %	50 %	50 %	222083211
1507	NC_011984	ATC	2	6	80296	80301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083211
1508	NC_011984	GCG	2	6	80320	80325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083211
1509	NC_011984	CGG	2	6	80436	80441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083211
1510	NC_011984	CAC	2	6	80463	80468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083211
1511	NC_011984	GGT	2	6	80487	80492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083211
1512	NC_011984	GAA	2	6	80524	80529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083211
1513	NC_011984	GCG	2	6	80537	80542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083211
1514	NC_011984	TGCT	2	8	80614	80621	0 %	50 %	25 %	25 %	222083211
1515	NC_011984	TGC	2	6	80655	80660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083211
1516	NC_011984	ACTG	2	8	80701	80708	25 %	25 %	25 %	25 %	222083211
1517	NC_011984	GGTAG	2	10	80740	80749	20 %	20 %	60 %	0 %	222083211
1518	NC_011984	GCT	2	6	80779	80784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083211
1519	NC_011984	GCC	2	6	80786	80791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083211
1520	NC_011984	ATAA	2	8	80804	80811	75 %	25 %	0 %	0 %	222083211
1521	NC_011984	T	6	6	80846	80851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011984	CAGG	2	8	80870	80877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_011984	AAGC	2	8	80889	80896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_011984	CTT	2	6	80903	80908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011984	CGA	2	6	81011	81016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083212
1526	NC_011984	AGC	2	6	81163	81168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083212
1527	NC_011984	GA	3	6	81169	81174	50 %	0 %	50 %	0 %	222083212
1528	NC_011984	CGCC	2	8	81191	81198	0 %	0 %	25 %	75 %	222083212
1529	NC_011984	GAA	2	6	81218	81223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083212
1530	NC_011984	CG	3	6	81317	81322	0 %	0 %	50 %	50 %	222083212
1531	NC_011984	GAA	2	6	81353	81358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083212
1532	NC_011984	GC	3	6	81397	81402	0 %	0 %	50 %	50 %	222083212
1533	NC_011984	AGA	2	6	81459	81464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011984	GGC	2	6	81536	81541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_011984	AAAC	2	8	81574	81581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_011984	CG	3	6	81628	81633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_011984	ACGC	2	8	81648	81655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_011984	AC	3	6	81671	81676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_011984	TTG	2	6	81717	81722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083213
1540	NC_011984	GCC	2	6	81725	81730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083213
1541	NC_011984	TCG	2	6	81733	81738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1542	NC_011984	CGA	2	6	81754	81759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1543	NC_011984	CGGA	2	8	81772	81779	25 %	0 %	50 %	25 %	222083213
1544	NC_011984	TCG	2	6	81887	81892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1545	NC_011984	CCG	2	6	81901	81906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083213
1546	NC_011984	GACG	2	8	81933	81940	25 %	0 %	50 %	25 %	222083213
1547	NC_011984	CGT	2	6	81962	81967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1548	NC_011984	GCG	2	6	81994	81999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083213
1549	NC_011984	GCG	2	6	82026	82031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083213
1550	NC_011984	TCT	2	6	82054	82059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083213
1551	NC_011984	TCT	2	6	82114	82119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083213
1552	NC_011984	GAT	2	6	82121	82126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083213
1553	NC_011984	CAT	2	6	82133	82138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083213
1554	NC_011984	CAT	2	6	82204	82209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083213
1555	NC_011984	TCG	2	6	82243	82248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1556	NC_011984	CGA	2	6	82288	82293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1557	NC_011984	CGC	2	6	82304	82309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083213
1558	NC_011984	CTGC	2	8	82337	82344	0 %	25 %	25 %	50 %	222083213
1559	NC_011984	CCA	2	6	82390	82395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083213
1560	NC_011984	TCG	2	6	82431	82436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1561	NC_011984	CAA	2	6	82462	82467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083213
1562	NC_011984	ACGC	2	8	82712	82719	25 %	0 %	25 %	50 %	222083213
1563	NC_011984	CGT	2	6	82723	82728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1564	NC_011984	CAG	2	6	82733	82738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1565	NC_011984	GTC	2	6	82739	82744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1566	NC_011984	CAC	2	6	82751	82756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083213
1567	NC_011984	GCT	2	6	82976	82981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1568	NC_011984	TCGC	2	8	82982	82989	0 %	25 %	25 %	50 %	222083213
1569	NC_011984	CGCC	2	8	83020	83027	0 %	0 %	25 %	75 %	222083213
1570	NC_011984	CGA	2	6	83080	83085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083213
1571	NC_011984	GTT	2	6	83099	83104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083213
1572	NC_011984	ATG	2	6	83115	83120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083213
1573	NC_011984	TGA	3	9	83176	83184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083214
1574	NC_011984	GTC	2	6	83186	83191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1575	NC_011984	GCGTG	2	10	83237	83246	0 %	20 %	60 %	20 %	222083214
1576	NC_011984	GAG	2	6	83384	83389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083214
1577	NC_011984	CCG	2	6	83406	83411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1578	NC_011984	GA	3	6	83457	83462	50 %	0 %	50 %	0 %	222083214
1579	NC_011984	CAG	2	6	83467	83472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1580	NC_011984	GCG	2	6	83517	83522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083214
1581	NC_011984	CG	3	6	83595	83600	0 %	0 %	50 %	50 %	222083214
1582	NC_011984	GCA	2	6	83610	83615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1583	NC_011984	GGCGA	2	10	83631	83640	20 %	0 %	60 %	20 %	222083214
1584	NC_011984	GCC	2	6	83684	83689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1585	NC_011984	CTT	2	6	83701	83706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083214
1586	NC_011984	GCC	2	6	83712	83717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1587	NC_011984	CG	3	6	83736	83741	0 %	0 %	50 %	50 %	222083214
1588	NC_011984	CG	4	8	83749	83756	0 %	0 %	50 %	50 %	222083214
1589	NC_011984	TCG	2	6	83757	83762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1590	NC_011984	GGTTG	2	10	83768	83777	0 %	40 %	60 %	0 %	222083214
1591	NC_011984	GTC	2	6	83810	83815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1592	NC_011984	GAC	2	6	83843	83848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1593	NC_011984	CGGG	2	8	83850	83857	0 %	0 %	75 %	25 %	222083214
1594	NC_011984	GAC	2	6	83875	83880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1595	NC_011984	TTG	2	6	83929	83934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083214
1596	NC_011984	CAG	2	6	83945	83950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1597	NC_011984	TTG	2	6	83955	83960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083214
1598	NC_011984	GTC	2	6	83972	83977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1599	NC_011984	CCGG	2	8	83991	83998	0 %	0 %	50 %	50 %	222083214
1600	NC_011984	AGC	2	6	84006	84011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083214
1601	NC_011984	CGC	2	6	84089	84094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1602	NC_011984	GCC	2	6	84126	84131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1603	NC_011984	GAT	2	6	84134	84139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083214
1604	NC_011984	CCG	2	6	84151	84156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1605	NC_011984	GCC	2	6	84228	84233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1606	NC_011984	GCC	2	6	84237	84242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083214
1607	NC_011984	CGG	2	6	84281	84286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083214
1608	NC_011984	ACC	2	6	84306	84311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083214
1609	NC_011984	TTGCC	2	10	84459	84468	0 %	40 %	20 %	40 %	222083215
1610	NC_011984	TGG	2	6	84753	84758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083215
1611	NC_011984	CGA	2	6	84759	84764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083215
1612	NC_011984	CGA	2	6	84813	84818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083215
1613	NC_011984	AGC	2	6	84926	84931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083215
1614	NC_011984	TTCCG	2	10	85009	85018	0 %	40 %	20 %	40 %	222083215
1615	NC_011984	CTT	2	6	85020	85025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083215
1616	NC_011984	GCC	2	6	85048	85053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083215
1617	NC_011984	ACGA	2	8	85084	85091	50 %	0 %	25 %	25 %	222083215
1618	NC_011984	CGG	2	6	85129	85134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083215
1619	NC_011984	CAGG	2	8	85143	85150	25 %	0 %	50 %	25 %	222083215
1620	NC_011984	TCG	2	6	85155	85160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083215
1621	NC_011984	GACG	2	8	85161	85168	25 %	0 %	50 %	25 %	222083215
1622	NC_011984	GAAGAC	2	12	85200	85211	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222083215
1623	NC_011984	GTGAT	2	10	85220	85229	20 %	40 %	40 %	0 %	222083215
1624	NC_011984	CAT	2	6	85306	85311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083215
1625	NC_011984	CTT	2	6	85321	85326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083215
1626	NC_011984	GTA	2	6	85327	85332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083215
1627	NC_011984	CGC	2	6	85374	85379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083215
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1986	NC_011984	TCG	2	6	102544	102549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083229
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1999	NC_011984	GAA	2	6	103129	103134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_011984	GC	3	6	103155	103160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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